Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng guanidine thiocyanate at guanidine hydrochloride ay ang guanidine thiocyanate ay isang mas malakas na protein denaturant na mas karaniwang ginagamit sa RNA isolation, habang ang guanidine hydrochloride ay isang weaker protein denaturant na hindi gaanong ginagamit sa RNA isolation.
Ang Denaturation ay ang proseso kung saan ang mga protina ay nawawala ang kanilang quaternary structure, tertiary structure, at secondary structure na karaniwang naroroon sa kanilang katutubong estado. Magagawa ito sa pamamagitan ng paglalagay ng ilang panlabas na stress o mga compound tulad ng isang malakas na acid o base, isang concentrated inorganic na asin, isang organic solvent (alcohol, chloroform), agitation, radiation, o init. Ang Guanidine thiocyanate at guanidine hydrochloride ay dalawang magkaibang uri ng mga denaturant ng protina.
Ano ang Guanidine Thiocyanate?
Ang Guanidine thiocyanate (GTC) ay isang mas malakas na protina denaturing agent na mas karaniwang ginagamit sa RNA isolation. Ito ay kilala rin bilang guanidinium isothiocyanate (GITC). Bilang isang chaotropic agent, ito ay isang kemikal na tambalan na karaniwang ginagamit bilang isang pangkalahatang protina denaturant. Ang chaotropic agent ay isang molekula sa isang solusyon ng tubig na maaaring makagambala sa hydrogen bonding network sa pagitan ng mga molekula ng tubig. Ito ay may epekto sa katatagan ng katutubong estado ng iba pang mga molekula sa solusyon, tulad ng mga macromolecule tulad ng mga protina at nucleic acid sa pamamagitan ng pagpapahina ng hydrophobic effect. Ang mga chaotropic na ahente tulad ng guanidine thiocyanate ay nagbabawas sa dami ng kaayusan sa istruktura ng protina na nabuo ng mga molekula ng tubig pareho sa maramihan at hydration shell sa paligid ng hydrophobic amino acids. Maaari itong magdulot ng denaturation ng protina.
Guanidine thiocyanate ay maaaring gamitin upang i-deactivate ang mga virus tulad ng influenza na nagdudulot ng mga sakit tulad ng Spanish flu noong 1918. Samakatuwid, maaari itong magamit sa mga setup ng medikal o ospital. Higit pa rito, ginagamit din ang Guanidine thiocyanate upang i-lyse ang mga cell at mga partikulo ng virus sa mga pagkuha ng RNA at DNA. Dito, ang function ng guanidine thiocyanate ay upang tulungan ang lysing action at upang maiwasan ang aktibidad ng RNase enzymes at DNase enzymes sa pamamagitan ng denaturing. Ang mga enzyme na ito ay makakasira sa extract (RNA o DNA).
Ano ang Guanidine Hydrochloride?
Ang Guanidine hydrochloride (GdnHCl) ay isang mas mahinang protein denaturant na hindi gaanong ginagamit sa RNA isolation. Ito ay kilala rin bilang guanidinium chloride (GdmCl). Ito ay ang hydrochloride s alt ng guanidine. Ang guanidine hydrochloride ay chaotropic at isa sa mga denaturant na ginagamit sa physicochemical studies ng protein folding.
Figure 01: Guanidine Hydrochloride
Ang Guanidine hydrochloride ay mayroon ding kakayahan na bawasan ang aktibidad ng enzyme at pataasin ang solubility ng mga hydrophobic molecule. Karaniwan, sa mas mataas na konsentrasyon ng guanidine hydrochloride, ang mga protina ay nawawala ang kanilang nakaayos na istraktura. Ang mga protina ay malamang na maging random na nakapulupot sa ganitong konsentrasyon ng guanidine hydrochloride. Sa mga setup ng medikal o ospital, ang guanidine hydrochloride ay ipinahiwatig para sa pagbabawas ng mga sintomas ng panghihina ng kalamnan at madaling pagkapagod na nauugnay sa sakit na Eaton-Lambert syndrome. Higit pa rito, maaaring kabilang sa mga side effect ng paggamit ng guanidine hydrochloride ang peristalsis, pagtatae, at nakamamatay na bone marrow suppression.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Guanidine Thiocyanate at Guanidine Hydrochloride?
- Guanidine thiocyanate at guanidine hydrochloride ay dalawang magkaibang uri ng mga denaturant ng protina.
- Ang parehong mga denaturant ay may guanidine sa kanilang mga istruktura.
- Sila ay mga chaotropic agent.
- Ang parehong mga denaturant ay maaaring gamitin para sa RNA isolation.
- Ginagamit ang mga ito sa mga setup ng medikal o ospital.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Guanidine Thiocyanate at Guanidine Hydrochloride?
Ang
Guanidine thiocyanate ay isang mas malakas na ahente ng denaturant ng protina na mas karaniwang ginagamit sa RNA isolation, habang ang guanidine hydrochloride ay isang weaker protein denaturant na hindi gaanong ginagamit sa RNA isolation. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng guanidine thiocyanate at guanidine hydrochloride. Higit pa rito, ang chemical formula ng guanidine thiocyanate ay C2H6N4S, habang ang chemical formula ng guanidine hydrochloride ay CH5N3HCl.
Ang infographic sa ibaba ay nagpapakita ng mga pagkakaiba sa pagitan ng guanidine thiocyanate at guanidine hydrochloride sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – Guanidine Thiocyanate vs Guanidine Hydrochloride
Ang Guanidine thiocyanate at guanidine hydrochloride ay dalawang magkaibang uri ng mga denaturant ng protina. Ang parehong denaturants ay chaotropes. Ang Guanidine thiocyanate ay isang mas malakas na ahente ng denaturant ng protina na mas karaniwang ginagamit sa paghihiwalay ng RNA, habang ang guanidine hydrochloride ay isang mas mahinang denaturant ng protina na hindi gaanong ginagamit sa paghihiwalay ng RNA. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng guanidine thiocyanate at guanidine hydrochloride.
