Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng CRISPR at CRISPR Cas9 ay ang CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat) ay isang natural na nagaganap na prokaryotic immune defense mechanism habang ang CRISPR cas9 ay isang RNA-guided Cas9 nuclease na bahagi ng CRISPR adaptive immune system.
Ang CRISPR ay isang antiviral defense immune system na matatagpuan sa bacteria at archaea. Ito ay isang pamilya ng mga sequence ng DNA na matatagpuan sa bacterial genome. Binubuo ito ng mga pagkakasunud-sunod ng spacer na nagmula sa mga fragment ng DNA ng mga bacteriophage na dati nang nahawa sa kanila. Sa mga kasunod na impeksyon sa viral, ginagamit ng bakterya ang mga pagkakasunud-sunod na ito upang sirain ang viral DNA. Ang mga CRISPR sequence ay may maikling palindromic na pag-uulit at spacer sequence. Bukod dito, ang CRISPR na paulit-ulit na mga pagkakasunud-sunod ng spacer ay madalas na may nauugnay na mga gene na code para sa mga protina ng Cas. Ang Cas9 ay isang RNA guided endonuclease. Kasama ng mga sequence ng CRISPR, gumaganap ang Cas9 protein bilang adaptive immune system sa bacteria laban sa mga bacteriophage.
Ano ang CRISPR?
Ang CRISPR ay nangangahulugang Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Ito ay isang kumpol ng mga sequence ng DNA na matatagpuan sa bacterial genome. Gumagana ito bilang isang natural na mekanismo ng pagtatanggol sa bakterya, at ito ay unang nakilala sa E. coli. Sa bacteria, ito ay gumaganap bilang adaptive immune protection, lalo na laban sa bacteriophages. Samakatuwid, isa itong mekanismong tukoy sa pagkakasunud-sunod.
Figure 01: CRISPR
Ang CRISPR system ay naglalaman ng ilang maikling-segment na DNA repeat sequence. Ang mga pag-uulit na ito ay palindromic, na may parehong base sequence kapag nagbabasa mula 5' hanggang 3' habang ang isa ay nagbibigay ng parehong sequence kapag nagbabasa mula 3' hanggang 5'. Bukod dito, ang mga pag-uulit ay magkapareho. Matatagpuan ang mga ito sa pagitan ng maikling "spacer" na mga sequence ng DNA na hindi magkapareho. Ngunit ang mga pagkakasunud-sunod ng spacer DNA na ito ay magkapareho o tumutugma sa dayuhang bacteriophage DNA. Ang mga gene na nauugnay sa CRISPR ay kilala bilang CRISPR associated genes o Cas genes. Cas genes code para sa mga protina ng Cas na mga helicase o nucleases. Ang mga helicase ay nag-unwind ng DNA habang ang mga nucleases ay pinuputol ang DNA. Sa pangkalahatan, kung isasaalang-alang ang CRISPR, ito ay isang immune system ng bacteria na gumagana laban sa mga bacteriophage (bacteria infecting virus).
Ano ang CRISPR Cas9?
Ang Cas9 o CRISPR na nauugnay na protina 9 ay isang bacterial RNA-guided endonuclease. Samakatuwid, ito ay isang enzyme na kinikilala at pinuputol ang target na DNA (lalo na ang bacteriophage DNA) na pantulong sa gabay na RNA. Ito ay nagdadala ng strand-specific na cleavage. Ang protina ng Cas9 ay naka-code ng isang CRISPR na nauugnay na gene. Ang CRISPR cas9 ay ang RNA-guided CRISPR-Cas9 nuclease system na maaaring magamit bilang isang RNA-programmable DNA targeting at editing platform para sa genome editing, transcriptional perturbation, epigenetic modulation, at genome imaging. Ang CRISPR cas9 system na ito ay napakasikat sa kasalukuyang genome editing system.
Figure 02: CRISPR Cas9
Sa kasalukuyan, ang CRISPR/Cas9 system ay ginagamit upang baguhin o baguhin ang mammalian genome sa pamamagitan ng alinman sa transcription repression o activation. Ang mga selulang mammalian ay maaaring tumugon sa CRISPR/Cas9 mediated DNA break sa pamamagitan ng paggamit ng mekanismo ng pag-aayos. Maari itong gawin gamit ang non-homologous end joining method (NHEJ) o homology-directed repair (HDR). Ang parehong mekanismo ng pag-aayos na ito ay nagaganap sa pamamagitan ng pagpapakilala ng mga double-stranded break. Nagreresulta ito sa pag-edit ng mammalian gene. Ang NHEJ ay maaaring humantong sa ablation ng mga mutation ng gene at maaaring magamit upang lumikha ng pagkawala ng mga epekto ng function. Maaaring gamitin ang HDR para sa pagpapakilala ng mga partikular na point mutations o pagpapakilala ng mga segment ng DNA na may iba't ibang haba. Sa kasalukuyan, ang CRISPR/Cas system ay ginagamit sa mga larangan ng therapeutic, biomedical, agricultural at research application.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng CRISPR at CRISPR Cas9?
- Ang Cas9 ay bahagi ng CRISPR Cas system.
- Ang Crisper cas9 system ay isang immune system na natural na matatagpuan sa bacteria.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng CRISPR at CRISPR Cas9?
Ang CRISPR ay isang kumpol ng mga DNA sequence na matatagpuan sa bacterial genome na gumagana bilang isang natural na sistema ng depensa laban sa mga bacteriophage. Binubuo ito ng regular na interspaced na maikling palindromic repeats, spacer at nauugnay na mga gene. Sa kaibahan, ang cas9 ay isang CRISPR na nauugnay na protina 9, na isang RNA guided endonuclease enzyme. Kinikilala at tinatanggal nito ang DNA double strands ng mga virus. Sa katunayan, ito ay bahagi ng sistema ng pagtatanggol ng CRISPR. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng CRISPR at CRISPR cas9.
Buod – CRISPR vs CRISPR Cas9
Ang CRISPR Cas system ay isang microbial defense system. Ang CRISPR ay isang kumpol ng mga sequence ng DNA na binubuo ng palindromic short repeats, spacer sequence at nauugnay na mga gene. Ang Cas9 ay isang Cas protein na isang RNA guided endonuclease. Ang CRISPR at Cas9 na protina ay gumagawa ng immune system na gumagana laban sa mga impeksyon ng bacteriophage sa bakterya. Ang protina ng Cas9 ay nakakapag-cleave ng foreign viral DNA at nakakagambala sa kanila. Ginagabayan ng CrRNA ang cas9 upang makilala ang viral DNA. Samakatuwid, ang CRISPR cas9 system ay isang natural na immune system na matatagpuan sa bacteria laban sa mga virus. Kaya, ito ang buod ng pagkakaiba sa pagitan ng CRISPR at CRISPR cas9.
