Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng genetic linkage at linkage disequilibrium ay ang genetic linkage ay ang tendensya ng dalawa o higit pang mga gene ng parehong chromosome na manatiling magkasama sa proseso ng inheritance habang ang linkage disequilibrium ay ang non-random association ng mga alleles sa magkaibang lugar sa isang populasyon.
Ang Genetic linkage at linkage disequilibrium ay dalawang konsepto sa genetics na sumusunod sa hindi Mendelian inheritance. Ang genetic linkage ay tumutukoy sa pisikal na estado ng pagkakaugnay sa isang chromosome. Sa simpleng salita, ito ang proseso kung saan ang mga gene ay malapit na matatagpuan sa isang chromosome upang palagi silang minana nang magkasama sa mga gametes. Sa kabilang banda, sa genetics ng populasyon, ang linkage disequilibrium ay tumutukoy sa hindi random na samahan ng mga alleles sa iba't ibang loci sa isang populasyon. Ito ang sukatan ng pagkakaiba sa pagitan ng naobserbahang dalas ng isang partikular na kumbinasyon ng mga alleles sa dalawang loci at ang dalas na inaasahan para sa random na pagkakaugnay.
Ano ang Genetic Linkage?
Ang Genetic linkage ay ang phenomenon kung saan ang mga sequence ng DNA, lalo na ang mga gene, ay malapit na matatagpuan sa isang chromosome, palaging nagpapakita ng kanilang mana nang magkasama sa panahon ng meiosis phase ng sexual reproduction. Ang mga ito ay naka-link na mga gene. Ang mga naka-link na gene ay tinukoy bilang dalawa o higit pang mga gene na matatagpuan sa parehong chromosome at minana nang magkasama sa panahon ng homologous chromosome separation. Ang mga ito, ang mga naka-link na gene na ito ay palaging namamana nang magkasama ng mga supling. Ang mga naka-link na gene ay hindi malamang na maghiwalay sa panahon ng anaphase 1 at 2 ng meiosis sa panahon ng sekswal na pagpaparami.
Figure 01: Genetic Linkage
Ang genetic linkage ng mga gene na ito ay makikilala sa pamamagitan ng mga test cross, at ito ay sinusukat ng centimorgan (cM). Ang mga ito ay palaging ipinahayag nang magkasama sa mga supling dahil ang mga naka-link na gene ay hindi maaaring sari-sari nang nakapag-iisa sa panahon ng paghahati ng cell. Sa isang normal na dihybrid cross, kapag ang dalawang heterozygotes ay pinagtawid sa isa't isa, ang inaasahang phenotypic ratio ay 9:3:3:1. Gayunpaman, kung ang mga gene ay naka-link, ang inaasahang ratio na ito ay nagbabago dahil sa pagkabigo ng independiyenteng assortment ng mga alleles. Kung ang isang normal na dihybrid cross ay nagreresulta sa isang hindi inaasahang ratio, ito ay nagpapahiwatig ng genetic linkage.
Higit pa rito, ang mga naka-link na gene ay nagpapakita ng mas mababang pagkakataon para sa recombination. Ang mga gene na ito ay hindi rin sumusunod sa batas ni Mendel ng independiyenteng assortment. Samakatuwid, nagreresulta ito sa iba't ibang mga produkto kaysa sa karaniwang mga phenotype. Gayunpaman, ang mga naka-link na gene ay maaaring ma-unlink sa panahon ng meiosis sa proseso ng homologous recombination. Kapag nangyari ang homologous recombination, nagpapalitan sila ng mga segment ng chromosome. Nagiging sanhi ito ng paghihiwalay ng mga naka-link na gene, na nagbibigay-daan sa kanila na mamana nang nakapag-iisa. Kung perpektong naka-link ang mga gene, ito ay may zero recombination frequency.
Ano ang Linkage Disequilibrium?
Ang Linkage disequilibrium (LD) ay ang hindi random na pag-uugnay ng mga alleles ng iba't ibang loci sa isang populasyon. Sa madaling salita, ang linkage disequilibrium ay tumutukoy sa pag-asa ng mga frequency ng gene sa dalawa o higit pang loci. Ang allelic association at gametic disequilibrium ay dalawang kasingkahulugan ng linkage disequilibrium. Kinakalkula ito ng pagkakaiba sa pagitan ng naobserbahang dalas ng isang partikular na kumbinasyon ng mga alleles sa dalawang loci at ang dalas na inaasahan para sa random na asosasyon. Samakatuwid, sinusukat ng LD ang paglihis mula sa inaasahan ng hindi pagkakaugnay kasama ang genome. Kapag mayroong linkage disequilibrium, ang dalas ng pagkakaugnay ng iba't ibang alleles ay mas mataas o mas mababa kaysa sa inaasahang dalas (kapag sila ay independyente at nauugnay nang random).
Figure 02: Linkage Disequilibrium
Maraming salik na nakakaapekto sa linkage diquilibrium. Ang ilan ay ang pagpili, rate ng genetic recombination, mutation rate, genetic drift, ang sistema ng pagsasama, istraktura ng populasyon, at genetic linkage. Sa genetic na pag-aaral, ang linkage disequilibrium ay isang mahalagang konsepto dahil ito ay kapaki-pakinabang para sa pagtukoy o paglo-localize ng mga gene na nauugnay sa pagkamaramdamin sa sakit. Bukod dito, ang LD ay isang malakas na senyales ng mga proseso ng genetic ng populasyon, lalo na sa kasaysayan ng populasyon ng tao. Kapaki-pakinabang din ang LD sa pagmamapa ng kumplikadong sakit o mga gene na nauugnay sa katangian.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa pagitan ng Genetic Linkage at Linkage Disequilibrium?
- Ang genetic linkage at linkage disequilibrium ay dalawang konsepto na tumutulong sa genetic studies upang mapag-aralan ang mga gene na responsable para sa mga sakit.
- Ang parehong konsepto ay hindi sumusunod sa mga batas ni Mendel.
- Ang mga konseptong ito ay nauugnay sa mga alleles sa loci sa mga chromosome.
- Bukod dito, mahalaga ang mga ito upang mapag-aralan ang pagbuo ng gamete sa panahon ng sekswal na pagpaparami.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Genetic Linkage at Linkage Disequilibrium?
Ang Genetic linkage ay ang proseso kung saan ang mga gene o DNA sequence ay napakalapit sa isang chromosome. Samantala, ang linkage disequilibrium ay ang pagkakaiba sa pagitan ng naobserbahang dalas ng isang partikular na kumbinasyon ng mga alleles sa dalawang loci at ang dalas na inaasahan para sa random na asosasyon. Kaya, ito ang pagkakaiba sa pagitan ng genetic linkage at linkage disequilibrium.
Higit pa rito, ang mga genetic linkage ay mahalaga sa pagtukoy sa likas na katangian ng saklaw ng hybridization at mga programa sa pagpili at pagpapanatili ng mga linya ng magulang. Samantala, ang linkage disequilibrium ay kapaki-pakinabang para sa pagtukoy o pag-localize ng mga gene na may kaugnayan sa pagkamaramdamin sa sakit, pagsusuri ng mga proseso ng genetic ng populasyon, lalo na sa kasaysayan ng mga populasyon ng tao at sa pagmamapa ng kumplikadong sakit o mga gene na nauugnay sa katangian. Kaya, isa rin itong pagkakaiba sa pagitan ng genetic linkage at linkage disequilibrium.
Buod – Genetic Linkage vs Linkage Disequilibrium
Ang Genetic linkage ay ang tendensya ng dalawa o higit pang mga gene ng parehong chromosome na manatiling magkasama sa proseso ng inheritance habang ang linkage disequilibrium ay tumutukoy sa hindi random na pagkakaugnay ng mga alleles sa dalawa (o higit pang) loci. Samakatuwid, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng genetic linkage at linkage disequilibrium.
