Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng conserved at consensus sequence ay ang conserved sequence ay tumutukoy sa magkatulad na sequence ng mga nucleic acid o amino acid na nangyayari sa iba't ibang o parehong species sa mga henerasyon habang ang consensus sequence ay isang karaniwang nakakaharap na nucleotides sequence o amino acid sequence na natagpuan sa isang napaka-conserved na rehiyon ng DNA o RNA o protina.
Ang mga organismo ay nagbabahagi ng magkatulad at magkaibang katangian. Kapag pinag-aaralan ang mga relasyon sa pagitan ng mga organismo at pag-uuri sa kanila, napakahalaga ng genome o genetic makeup ng mga organismo. Mayroong ilang mga nucleotide o amino acid sequence na karaniwan sa iba't ibang organismo. Ang conserved sequence ay isang nucleic acid o amino acid sequence na pare-pareho sa mga species. Samakatuwid, sila ay phylogenetically mahalaga kapag bumubuo ng phylogenetic puno. Sa conserved sequence, may mga partikular na nucleotide sequence na mas karaniwang matatagpuan. Kilala ang mga ito bilang consensus sequence.
Ano ang Conserved Sequence?
Ang conserved sequence ay isang nucleic acid sequence o amino acid sequence na katulad ng mga species. Samakatuwid, ito ay pare-pareho sa buong species sa buong ebolusyon. Sa pangkalahatan, ang mga pagkakasunud-sunod na ito ay pinananatili ng natural na pagpili. Sila ay nananatiling hindi nagbabago malayo sa likod ng phylogenetic tree. Samakatuwid, mahalaga ang mga conserved sequence sa pagbuo ng mga phylogenetic tree. Ito ay pinaniniwalaan na ang mga napaka-conserved na pagkakasunud-sunod ay kadalasang may mahalagang functional na halaga. Ang mga ito ay kapaki-pakinabang din sa pagtukoy ng mga genetic na sakit. Gayunpaman, ang mga conserved sequence ay maaaring coding o non-coding na nucleic acid sequence. Bilang karagdagan, ang mga conserved sequence ay nagpapakita ng mas mabagal na rate ng mutation. Samakatuwid, nagpapakita sila ng napakaliit na pagbabago sa kanilang komposisyon; minsan, hindi sila nagpapakita ng mga pagbabago sa lahat ng henerasyon.
Figure 01: Conserved Sequence
Ang RNA na bahagi ng mga ribosom ay naroroon sa lahat ng mga domain ng buhay, ang mga pagkakasunud-sunod ng homeobox sa mga eukaryote, at ang tmRNA sa bacteria ay ilang mga halimbawa ng mga napaka-conserved na pagkakasunud-sunod. Ang pagkakakilanlan ng mga conserved sequence ay madali kapag ang bioinformatics ay lumalapit, lalo na ang sequence alignment tool, ay ginagamit. Bukod dito, pinapadali ng multiple sequence alignment ang visualization ng conserved sequence.
Ano ang Consensus Sequence?
Ang consensus sequence ay isang sequence na karaniwang makikita sa isang partikular na conserved region ng DNA o RNA. Ito ay isang napaka tiyak na pagkakasunud-sunod ng nucleotide. Bilang halimbawa, mayroong consensus sequence sa -10 bilang TATAAT (Pribnow box) sa E. coli promoters, na lubos na conserved sequence. Katulad nito, mayroong isa pang pagkakasunud-sunod ng pinagkasunduan: TTGACA sa E. coli promoters sa -35 din. Ang mga pagkakasunud-sunod ng pinagkasunduan ay kilala rin bilang "mga kahon".
Figure 02: Consensus Sequence
Bukod sa DNA at RNA, ang mga protina ay mayroon ding consensus sequence ng mga amino acid. Ang mga site na nagbubuklod ng protina ay madalas na kinakatawan ng mga pagkakasunud-sunod ng pinagkasunduan. Ang mga restriction enzymes ay mayroon ding consensus sequences. Bukod dito, ang mga site ng splice ay mga pagkakasunud-sunod din ng pinagkasunduan. Katulad ng mga conserved sequence, ang consensus sequence ay maaaring kalkulahin at makita ng mga bioinformatics tool.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Conserved at Consensus Sequence?
- Ang conserved at consensus sequence ay mga nucleic acid o amino acid sequence na karaniwan sa lahat ng species.
- Ang parehong conserved at consensus sequence ay maaaring makita ng bioinformatics tool.
- Malawakang ginagamit ang mga ito sa molecular biology.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Conserved at Consensus Sequence?
Ang conserved sequence ay isang nucleic acid o amino acid sequence na pare-pareho sa mga species habang ang consensus sequence ay napaka-spesipiko at karaniwang nakikitang mga base o amino acid sa isang partikular na conserved na rehiyon. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng conserved at consensus sequence. Bukod dito, ang isa pang pagkakaiba sa pagitan ng conserved at consensus sequence ay ang conserved sequence ay phylogenetically important habang ang consensus sequence ay madalas na protein binding site, splice site, restriction enzyme cutting site, atbp.
Buod – Conserved vs Consensus Sequence
Ang Conserved sequence ay ang mga sequence ng mga nucleic acid o protina na magkatulad sa mga nabubuhay na species. Ang isang promoter, ribosome binding site, isang pinagmulan ng replication at amino acid sequence ng histone protein ay ilang mga halimbawa ng conserved sequence. Sa kabaligtaran, ang mga pagkakasunud-sunod ng pinagkasunduan ay mga partikular na base o amino acid na mas karaniwang matatagpuan sa isang naibigay na conserved sequence. -10 box, -35 box ng E. coli promoter, protein binding sites, splice sites at restriction enzymes na kumikilala sa mga site ay ilang halimbawa ng consensus sequence. Kaya, ito ang buod ng pagkakaiba sa pagitan ng conserved at consensus sequence.
